接下來就是選擇相應的竹紙與皮紙，對書葉破損處的蟲蛀孔洞、斷口及脆化的部位進行修復與加固。
由于竹紙呈黃色略帶白色，皮紙近白色。這兩種紙在紙張顏色上與原帖有較大差別，因此還需要對所選的補紙進行適當染色，達到修復后的效果能與原書葉相互協調、自然。
調色所用的材料周至一般會用各種中藥材，不過對于這兩個拓本來說，選用西方人常喝的紅茶包就夠了。
取紅茶適量加水煮開。同時用干凈的小紙條試色，顏色深適當加水，反之可以適當加一點紅茶，反復幾次試色直至接近原紙顏色，茶水就配好了。
將紙以浸染的方式投入水槽中，浸染時間控制在三十分鐘，后逐頁揭開、提起晾至七分干，然后重新噴水濕潤，壓平，再與待修復處像對照，直到經過染色的竹紙與皮紙與待修處的紙張顏色用肉眼無法分辨后，方才合用。
《瘞鶴銘》破損的蟲蛀孔洞主要集中在天頭、地腳。將拓本打開，正面向下，放于事先鋪好纖維紙冷光源透光工作臺上，修復破損的孔洞按照“先中間后兩邊”及“先補大，后補小”的順序。用毛筆沾漿水，抹在孔洞四周，用配好的補紙，對好紙紋，平貼在孔洞上，稍加按壓，蓋上吸水紙吸去多余水分及余漿。
再用鑷子依糨糊濕印撕去多余的補紙，同時對搭縫進行精細處理。考慮到孔洞四周紙張物理性能有所下降，為更好地保護拓本，需要在對搭縫進行處理時，視實際情況適當擴展搭接處的寬度，一般控制在20—25毫米，以適當增加孔洞四周的拉力。
而對于斷裂、脆化部位加固，因長期外力作用，折縫有卷曲、折斷、毛口等現象。地腳的不少部位有顏色較深的脆化痕跡。
通過肉眼觀察，可以發現拓本之前就應在這些部位出現過斷裂，而且經過精心的修補，對于這些部位，處理斷裂的方式，是事先撕好的皮紙條進行黏接，黏接方式是先拼對好縫隙，在兩片單葉之間留有一絲空隙，自上而下抹漿水，將皮紙條貼于書口處蓋上吸水紙，吸去水分，稍按壓、黏緊，對地腳有脆化的部位同樣抹漿水，也用皮紙條進行平貼，按壓緊實，視實際需要撕去多余補紙邊。
需要注意的是，手工紙張其實是分正反面的，就是從紙漿水里將竹席抄起來后，貼著竹席的那一面和面對空氣這一面，其纖維密度和組織方式上，是存在細微的差別的。
此外因為竹簾上細竹絲的存在，也會導致紙張的疏密狀態呈現稀疏交替的現狀分布，所以在修補的時候，還要注意這些細節，將疏密、正反和方向都要與原本的紙張對齊。
在修復的過程中，周至還發現前代修復者雖然手藝高超，但是首先于補紙的選擇有限，故而在當時修復時，所用補紙厚度大于了原紙，而修復接縫處，可能又受限于視力，有些過寬。
這兩種情況就會導致修復后的的拓本書頁不平整，尤其是后天被蟲蛀以后，孔洞周圍會生長出類似核桃紋的皺褶。
不少經過修復的部位，看著沒什么，觸手就會感覺到發硬，致使整冊書的天頭、地腳的厚度，略高于其他部位。
發現了這個新情況后，周至決心對原修的這些隱患部位進行改進。</p>